Полимерный слой может использоваться как непосредственно для
формирования наноструктур, так и в качестве маски для последующеготравления, что позволяет перенести сформированный рельеф в другой материал. Процесс травления с использованием НПЛ маски показан на Рисунке 3. Сначала наноструктура переносится в полимерный слой, нанесённый на целевую подложку, с помощью НПЛ. Важным шагом этого этапа является удаление тонкого слоя полимера, оставшегося по скопированной структурой после НПЛ, при помощи предварительного травления кислородной плазмой (plasma ashing). После этого структурированный слой НПЛ полимера используется как маска для плазменного травления. Разница в толщине участков полимерной маски приводит к разной задержке начала травления подложки — более тонкие области открывают доступ к подложке раньше, чем толстые. При правильно подобранном режиме травления этот эффект позволяет напрямую воспроизвести сложные трёхмерные профили маски в материале подложки. Хотя данный подход упрощает процесс изготовления по сравнению с традиционными литографическими методами, позволяя создавать 3D-структуры за один этап, он имеет свои ограничения. Во-первых, толщину остаточного слоя под отпечатанным рисунком необходимо минимизировать, чтобы его удаление не привело к деградации элементов структуры. Во-вторых, требуется разработка подходящего процесса травления, способного переносить различные 3D-формы с маски в подложку с минимальными искажениями критических размеров. Это особенно сложно, поскольку разные элементы одной наноструктуры часто демонстрируют существенно разные скорости травления. Если такие искажения неизбежны, их следует компенсировать на этапе создания мастер-штампа — при условии, что деформации исходного рисунка известны и стабильны в рамках
производственного процесса.